In Stardew Valley gibt es neben den Obstbäumen andere Bäume (engl.: Trees) die keine Früchte tragen. Dazu gehören Ahorn, Eichen und Kiefern.
Bäume verbreiten sich schnell und bieten verschiedene Ressourcen wie Holz, Saft und Samen der jeweiligen Spezies. Man sollte vorbeugende Maßnahmen treffen und Bäume vorsorglich dort abholzen wo Später ein Feld entstehen soll, da sie sehr schnell wachsen und sonst im Weg stünden.
- Im Erdreich eingebettete Samen können mit einer Hacke hervogeholt und mit einer Picke zerstört werden. Die Samen werden sonst nur von Objekten welche ihnen im Weg sind am Wachstum gehindert. Dazu gehören Unkraut, Steine und Stöcke. Samen die von benachbarten Bäumen herrabfallen, "zerstören" einen Bereich an Gras um dort zu wachsen.
- Sprösslinge können mit einer Sense oder dem Schwert abgeschnitten, mit einer Picke zerstört oder mit einer Axt zu einem kleinen Anteil Holz verarbeitet werden.
- Um Setzlinge mit der Axt zu zerhacken ist mehr Schwung als bei ausgewachsenen Bäumen von Nöten. Um zur vollen größe allerdings herranzuwachsen, müssen die benachbarten acht Blöcke entfernt werden.
- Um die beim Fällen von Bäumen zurückgebliebenen Baumstümpfe zu entfernen, benötigt man eine Level 2-Axt. Man erhält hierbei hartes Holz.
Baumstümpfe sind derzeit auch noch in der Lage Samen auf die angrenzenden Felder zu verbreiten. Es ist nicht sicher ob es sich hierbei um einen Fehler handelt oder beabsichtigt ist.